Isefjorden er en ca. 35 km lang og 305 km2 stor tærskelfjord, hvilket betyder, at den indre del er væsentlig dybere end den ydre del. Fjorden ligger i Nordvestsjælland og har sit udløb i Kattegat mellem Hundested og Rørvig.
Dele af Isefjorden har flere selvstændige navne; den hedder således Lammefjorden, Holbæk Fjord og Tempelkrogen ved Holbæk.
Isefjorden er 5-7 meter dyb i gennemsnit med en største dybde på 17 meter på vestsiden af Orø.